Po Kustiću tako za pedofilski skandal u Crkvi ne možemo kriviti svećenike koji su silovali djecu u nizu zemalja (SAD, Australija, Njemačka, Nizozemska, Italija…) nego – zavjeru ateista.

Kustić je tako u razgovoru za Globus ustvrdio da 'Katoličku crkvu koja jest slaba i grešna, ali je ipak Crkva, napadaju već stoljećima'.

'Oni koji nalaze načina da grijehe i slabosti njezinih svećenika tako uveličaju da Crkva ostane bez ugleda u narodu. Nekome taj njezin ugled smeta. Ja sam, nažalost, tijekom svojih dugih novinarskih i svećeničkih godina ustanovio tu odbojnost jednog dijela ljudi prema Crkvi. Ta je odbojnost vrlo konkretna. Možda Crkva ide ljudima na živce i zato što toliko govori o moralnosti, osobito na seksualnom planu, a pritom nije uvijek savršena moralnost njezinih službenika. Pa su ljudi pomalo ljutiti i zavidni. Ljudi ne vjeruju, čak mnogi kršćani, formalno katolici, u svećeničko suzdržavanje od seksa. O tome se puno priča i puno misli i puno naklapa. A ovo sada prilika je da se Crkva i svećenici podbodu', smatra Živko Kustić

Na novinarsko pitanje ne čini li mu se to sve kao teorija zavjere, Kustić odgovara: 'Postoje organizirane snage koje svuda na svijetu promišljeno i sustavno rade protiv Crkve i protiv kršćanstva uopće. I koje su jako povezane i konstantno djeluju. Ovaj sadašnji napadaj na papu pokazuje da su zaista organizirani i da zaista znaju što hoće, jer je broj tih slučajeva razmjerno malen, značajan je, ali malen, i nije razlog da se digne tolika galama na Crkvu kao Crkvu.'

Aktualni papa Benedikt XVI., ranije poznat pod imenom Joseph Ratzinger, i osobno je prozvan u pedofilskoj aferi. No Kustić o njemu ima nešto drukčije mišljenje.

'To je čovjek visokog morala, visoke teologije, veliki mislila, pisac. A to što mu sada hvataju da je možda znao za neki slučaj, a da ga nije odmah prijavio vlastima – znate što ću vam reći? I kad o sebi razmislim, pitanje je bih li svakog znanca koji je nešto grešno počinio prijavio vlastima ili bih pokušao djelovati na njega da se promijeni', rekao je Kustić.

'Ovaj konkretni napad na Ratzingera, mislim da je to eskalacija jednog sustavnog, godinama vođenog napadaja da Katoličku crkvu koji je počeo u Americi i sad se proširio i na dobar dio Europe. Ne možemo popovima ništa, sada ćemo ih uloviti da se sa djecom seksaju', dodao je.

Kolumnist Jutarnjeg lista i svećenik uvjeren je da su optužbe protiv Ratzingera izmislili nevjernici i ateisti.

'Ja sam našim komunistima, i starijima i mlađima od sebe, znao govoriti: 'Znate samo dvije stvari: nema Boga, udri popa!' Udariti popa – to im je gušt. Isto tako i udariti po papi, tamo gdje je najosjetljiviji, iako jako dobro znaju da je ovaj papa ostao na apsolutno moralnoj razini', zaključio je Kustić.