Osumnjičeni Zaur Dadajev, Anzor i Šadid Gubašev, Temirlan Eskerhanov i Hamzat Bahajev optuženi su za naručeno ubojstvo, te za nezakonito posjedovanje i krijumčarenje oružja, priopćili su istražitelji.
Za još jednog osumnjičenoga, Ruslana Muhudinova, vjeruje se da je naručio ubojstvo te su ga ruske vlasti stavile na međunarodnu listu traženih osoba. Vjeruje se da se Muhudinov trenutačno nalazi u Ujedinjenim Arapskim Emiratima, objavila je ruska novinska agencija RIA.
Dadajev, bivši pripadnik čečenskih vojnih snaga, bio je glavnoosumnjičeni za ubojstvo. On je navodno priznao ubojstvo na početku istrage i onda pokušao povući izjavu. Tada je rekao da je ubio Nemcova jer je vrijeđao islam i vođu većinski muslimanske ruske pokrajine Čečenije Ramzana Kadirova, prema medijskim izvješćima koji su citirali istražitelje.